卵巢囊肿根据大小、位置、性质不同，治疗方法不同。一般以手术治疗为主，要看是否恶性，囊肿的部位，体积，大小和生长速度。如畸胎瘤，B超、平片检查可发现牙齿、骨头等特殊结构，肿瘤超过3-4cm需要进行手术处理。其它囊肿、肿瘤并无此典型表现。
卵巢囊肿有生理性和病理性，生理性不用治疗，几周后可自行消失，病理性一般需要手术治疗，理疗效果不佳。可以先服用药物进行治疗，两个月后再复查，如果囊肿没有消失，多考虑是病理性的，如果不大，可定期复查，超过5.0cm可考虑手术治疗。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
卵巢囊肿的反应，有以下的症状：一，腹部增大，患者往往会感觉到衣服瘦、腰部发胖、轻轻按压会有坠物、不适应感等症状。二，下腹不适，其是卵巢囊肿的一个最初的症状，肿瘤本身的重量，受肠子蠕动的影响，可能会出现下腹和盆腔部分会有肿胀和下坠感。三，腹痛，卵巢囊肿在没有并发症之前，通常不会有明显的疼痛，一旦感觉腹部的疼痛，可能出现肿瘤扭转、破裂或感染等现象。
卵巢囊肿可以通过妇科彩超诊断，可以通过手术治疗。
卵巢囊肿是指卵巢内有囊性肿物形成，可见到能触动、有痛性或无痛、中等大小及以下的包块。多与遗传、内分泌、生活方式、环境因素有关。卵巢囊肿如果不影响月经和正常生育，并且活动度好、体积小、发生蒂扭转风险小的，可不给予临床干预，定期复查妇科彩超。如果体积大，生产速度快，容易发生卵巢蒂扭转的，建议采用手术切除。
