巧克力囊肿要到正规的三甲医院进行诊断，根据不同的病情来制定合理的治疗方案，接受系统、科学的治疗，只有对症治疗才会提高治好的几率，千万不要盲目去治疗，以免加重病情。
巧克力囊肿手术后可以积极选择按摩脐周，以及配合萝卜汤等帮助排气较好，术后避免着凉，平时营养均衡多喝水，放松心情，多补充蛋白质如鸡蛋、鱼等，增强抵抗力，同时可以多吃一些水果和蔬菜，补充维生素。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，是子宫内膜异位到卵巢导致的囊肿，多数伴有痛经症状。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变，如果囊肿体积不是很大，没有出现严重的压迫症状，没有出现肾功能不全，可以不用手术，要密切观察定期复查，建议挂妇科。
巧克力囊肿坚持做仰卧起坐，能有效地锻炼腹部肌肉，可以提高人体的抗病能力，每天锻炼。慢跑也适合巧克力囊肿，坚持慢跑能促进人体新陈代谢，可以帮助身体排毒，可以提高自身的免疫功能。
患有巧克力囊肿后，想要用中药方法治疗，一定要在医生的指导下使用。患者切不可自己用药，中药贴剂治疗、中药汤剂治疗，巧克力囊肿这是一种子宫内膜异位增生的病变，要重视疾病的治疗，中医认为治疗巧克力囊肿首选食疗，饮食上要有足够的营养，不要偏食挑食。不要吃牛、羊、鱼、虾等发物。
以考虑通过手术的方式来进行解除的，避免肿瘤所造成的压迫。平常多注意生活规律，避免剧烈运动，多吃蔬菜水果，多加强营养，做好卫生防护。如果病情发现的比较早，治疗的比较及时，相信病情也是可以缓解的，在治疗过程当中，一定要把心情放松，思想上不要有什么压力。
