巧克力囊肿吃中药一般不能完全治好。通过吃中药可以缓解痛经的症状，可以在一定程度上控制巧克力囊肿的增长速度。如果吃中药想治好巧克力囊肿，不太可能。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢而形成的，一般选择手术治疗。对于有生育要求的女性，可以选择患侧的卵巢巧克力囊肿剥除手术。如果没有生育要求的女性，可以选择患侧的附件切除的手术治疗。手术之后的病人可以采用GnRh-a治疗，预防卵巢巧克力囊肿的复发等。
巧克力囊肿一般为患侧下腹钝痛，为输卵管膨大所致。有时呈阵发性绞痛，为卵管痉挛性收缩引起。下阴道排出大量液体后，疼痛随之缓解，少数出现剧裂腹痛，则系并发症引起。去专业正规的医院进行检查和治疗。尽量吃清淡一点，要忌生冷和茶，个人的卫生习惯也很重要，如，勤洗勤换，多用开水烫洗然后放在太阳底下暴晒。
患有巧克力囊肿要保证充分的睡眠，每天早起早睡，可以使皮肤变得更好，而且卵巢也会更健康。适量的喝红酒，红酒可以促进卵巢活性，从而提高卵子的质量。多吃豆制品，多吃一些豆腐、豆浆及豆制品，因为里面含有大量的植物蛋白，可以让卵巢更结实，卵子更健康。
生理性囊肿不需要手术，病理性囊肿通常需要手术来确认诊断并相应地治疗。去正规医院检查做B超。彩色B超，X线检查，腹腔镜检查等先进的诊断技术可用于卵巢囊肿的早期诊断。虽然卵巢囊肿易于恶变，但只要早期发现，早期发现和早期治疗都可以避免。
巧克力囊肿的护理要保证充分的睡眠：每天早起早睡，可以使皮肤变得更好，而且卵巢也会更健康。还可以适量喝些红酒：红酒可以促进卵巢活性，从而提高卵子的质量。多吃一些一些豆腐豆浆及豆制品，因为里面含有大量的植物蛋白，可以让卵巢更结实，卵子更健康。