怀孕期间可以进行核磁共振检查，因为孕妇有肥胖、羊水不足、胎儿已经进入盆内，或者是产前超声无法确认的情况。
可以为胎儿胃肠道和消化道的异常情况提供更多的补充资料。建议孕妇和家人不要害怕核磁共振会产生辐射，也不要担心会对胎儿的发育有什么影响。在怀孕的3个月内，胎儿正处在细胞的分化发育阶段，因此要避免做核磁共振。
在早产儿出生后和两岁时对他们进行核磁共振，可以了解婴儿脑白质状况。科学家通过核磁共振技术，定期扫描婴儿脑部的图像，并且将这些图像进行对比。就能发现早产儿是否有脑白质的损伤，如果没有就能确定婴儿的大脑发育基本正常，而如果脑白质发生了损伤，那么早产儿脑很可能会出现脑瘫、认知延迟以及视觉或听觉障碍等脑部疾病。
女性月经期间是可以做核磁共振的。
核磁共振没有放射性,检查前确定身上没有金属类物品,避免导致危险。经期做核磁共振提前跟医生沟通,若带有节育环不建议做核磁共振,因为节育环是金属类的。做核磁共振不会影响身体,部分患者会因封闭的空间导致幽闭空间恐惧综合症,感觉窒息、呼吸急促,这类症状极少见,女性经期做核磁共振没有多大影响。经期注意饮食,保持生活规律,女性经期身体虚弱,要多休息，饮食要清淡为主,不吃辛辣、刺激的食物,注意经期间护理，避免导致月经不调等情况。若是经期做检查,建议先跟医生沟通，了解注意事项,避免检查对患者带来不的影响。
脑部ct能观察脑内出血，梗塞，肿瘤，骨折，尤其是颅内的钙化。脑部核磁共振对早期脑梗塞观察比脑部ct要早。对于脑部病变，脑部核磁共振优于脑部ct。脑部核磁共振不用打造影剂，可以进行脑血管成像，对脑内神经病变显示比ct更清楚，更明确。而且核磁共振没有辐射损伤，这一点明显优于ct。因此脑部疾病检查尽量选择核磁共振。
脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
婴儿进行核磁共振通常是没有明显危害的，可以在医生指导下正常进行，无需特别处理。
对于婴幼儿来说，核磁共振是一种非常安全的检查方法，是一种使用高场强磁场进行检测的仪器，通常不会对人体造成任何的伤害，在临床上是一种常用的检查方法。但是磁共振检查耗时较久，噪声较大，婴儿可能不能配合检查，要先进行镇静。需要注意的是，当通过磁共振发现幼儿患有某些疾病的时候，最好是可以尽快的进行治疗，并且在选择药物的时候也应该要慎重。
