遗传基因缺陷，尤其是染色体异常的胚胎。外界不良因素，比如环境的原因，大气污染，还有一些化学物质和物理因素，可以直接或间接的对胚胎造成伤害。母体的因素，由某些全身性疾病可以引起胚胎死亡。内分泌功能失调，比如黄体功能不全，甲状腺功能低下等。
习惯性流产一般是一种妇女在每次自然流产后，持续两次或更多。经常做人流会造成子宫内膜太薄，不适合胎儿发育，这是造成习惯性流产的主要因素。也有可能是精子品质不正常、卵子品质不正常所引起的。
如果女性和女性都有遗传缺陷，那么就会出现习惯性堕胎。还有一些患了疱疹病毒和弓形虫的妇女也会有此症状，因此在进行习惯流产后要进行详细的体检，明确病因后再进行治疗。
稽留流产是胚胎停止发育后没有及时排出体外，滞留在宫腔内称为稽留流产。导致稽留流产的原因很多，如胚胎染色体异常，怀孕后激素水平异常，子宫内膜异常，子宫黏膜下肌瘤，药物影响，或接触毒性物质和放射物质等均可导致胚胎停育。发现稽留流产要及时住院治疗，可用雌激素3-5天后行清宫术，也可以行药物流产，必要时清宫。
完全流产可能是胚胎因素、母体因素、免疫功能异常等原因引起的。
1.胚胎因素：如果出现胎盘功能或分泌异常、染色体异常等情况，可能会使孕卵从附着处分离、出血，从而导致流产。
2.母体因素：如果孕妇患全身性疾病，或者存在生殖器官异常、内分泌异常，可能会引起机体内分泌的紊乱，进而容易出现流产的现象。
3.免疫功能异常：如果母体与胎儿的血型不匹配，可能会在母体产生抗体，从而导致胎儿的器官、组织等遭受损害，进而导致流产。
流产后腰疼是可能是子宫收缩、盆腔出血引起的。
做完人流后会引起腰部疼痛。术后还会有骨盆充血，也有腰痛的症状。但是，术后不能好好休息，长期从事重体力工作，长期站着都会引起腰部疼痛。流产后有可能会发生腰部疼痛，一般会伴有腹痛和阴道分泌物增加等症状，建议使用抗菌药物进行治疗，还需要注意清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，有利于身体健康。
输卵管妊娠流产的原因如下：
一、主要原因
输卵管内孕是因为输卵管内的蜕膜不完全，导致胚胎在生长过程中突出到管内，最后破裂导致的出血，进而引发流产。
1、辅助生殖技术的运用：一些妇女由于患有不孕，会采取辅助生殖技术，这样会提高输卵管怀孕的几率，导致输卵管妊娠流产。
2、宫内节育器的使用：如果植入了子宫节育器，发生细菌性的骨盆炎症或者是宫内节育器分泌出孕激素，都有可能引起输卵管怀孕，从而引起输卵管妊娠流产。