乙肝大三阳与小三阳之间存在差异，大三阳表明病毒复制较活跃，传染性相对较强。
小三阳一般提示病情处于慢性化，传染性较弱。当然，对乙肝患者来说，也以大三阳或小三阳为准，及乙肝DNA和其他有关数值，对疾病进行全面的分析和判断，及抗病毒治疗方案的指导。临床上主要使用的是拉米夫定联合利巴韦林进行抗病毒治疗。当前乙肝患者在接受了正规抗病毒治疗后，病情很平稳，而抗病毒治疗则需长期服药，现在口服药物治疗时间至少为4年，部分病人需终身服药。
乙肝小三阳和大三阳的区别通常在于指标、治疗方案等方面。
乙肝小三阳与乙肝大三阳是不一样的，乙肝小三阳是指乙肝表面抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体三个指标呈阳性，而乙肝大三阳则是指乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗体为阳性。乙肝小三阳患者只要肝功能正常，一般不需要进行任何的治疗，只需定期复查即可。而乙肝大三阳患者通常需要进行系统干预，以免肝功能严重受损。
大三阳和小三阳区别，有些“大三阳”的人，希望变成“小三阳”，甚至使用一些药物，其实大可不必。因为“大三阳”并不是肝功能受损的标志，区别大三阳与小三阳只是有可能比“小三阳”在血液中的病毒含量高一些，病毒复制相对活跃一些而已。
乙肝病毒携带者是指乙肝病毒携带者，其肝功能各项指标均正常，肝功能没有受到损害。而乙肝小三阳则是乙肝表面抗原、乙肝E抗体、乙肝核心抗体三项为乙肝病毒的免疫学指标为阳性。
乙肝小三阳具有病毒复制能力低、感染率低等特征，肝功能正常的乙肝小三阳，这种病人在2-3年内肝功能都是正常的，没有其他症状，这种小三阳可以被认为是乙肝病毒携带者。
乙肝疾病主要是分类携带者，大三阳或者是小三阳这几个方面，其中携带者和小三阳病毒数量都不是很高，这类人群也不用过度治疗，只要定期复查，病毒数量没有升高的情况下都不用去弹性，只有乙肝大三阳它的病毒数量在复制，所以需要治疗，这是他们两者的区别，还有就是引起肝脏损害可能性高。
乙肝大三阳是指乙肝5项中表面抗原阳性、E抗原阳性及核心抗体阳性，较多医院化验单是第1、3、5项；乙肝小三阳是表面抗原阳性、E抗体阳性及核心抗体阳性，是化验单中第1、4、5项。是否为乙肝携带者应根据肝功能判断，肝功提示有炎症不是携带者，应为乙肝病人，肝功正常者为乙肝携带者。大三阳可以表现为携带者，也可表现为乙肝病人，小三阳病人可表现肝功正常的携带者，也可表现为肝功异常的乙肝病人。