腭裂的治疗应采取综合序列治疗的原则，除外科手术以外，还需要采取一些非手术治疗，如正畸治疗，缺牙修复，语音治疗，以及心理治疗等。腭裂的临床特点是腭裂语音，单纯腭裂修复对语音改变不大，一般术后一个月应及时进行配合语音师进行语音训练。
可用以下方法进行治疗。手术治疗：利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。对症治疗：对腭隐裂的患儿可严密监护，只有当出现喂养、听力或语音问题时才考虑进行腭裂的修复。
手术时年龄比较大，容易形成不正确的发音，手术以后要想发出正确的语音，必须要进行术后语音矫治。这种语音矫正一般在术后1至2月开始是最好的。相信在医师和家人的指导在加上自己刻苦的练习会恢复正常语音的。
注意事项有应防止患儿用手搔抓伤口、拔掉唇弓或将手伸进口腔。必要时用小夹板使双上肢制动。护士小姐每日用消毒棉签清洁伤口，清除血痂和污物，保持局部清洁。家长不应自己擦拭伤口。
有软腭裂就可以做手术，尽量是在婴儿期就接受治疗，可以进行手术治疗，手术的目的就是闭合软腭部的裂隙，新生儿软腭裂一定要积极的治疗，为孩子的发音提供条件。新生儿软腭裂是属于先天性的口腔发育畸形，有时会与唇裂合并出现。
