治疗唇腭裂要进行手术治疗，唇腭的整形手术可能要分多次完成，寄希望于一次手术即可成功是不现实的。唇腭裂要初步诊断病患程度如何，尽快治疗、按照序列治疗的程序进行治疗。在唇腭裂手术时间方面,尽可能做到在2岁前完成腭裂修复术.对于裂隙较窄,手术后可不暴露或少暴露硬腭裸露骨面的患者,以一岁内完成唇腭裂整复手术为好.而对于裂隙严重,术后有可能遗留较大面积裸露骨面时,则可将手术时间适当延迟。
治疗的方法有原则治疗的方法腭裂的治疗是一个复杂的过程，需要口腔颌面外科、整形外科，口腔正畸科，语音训练科，精神及心理科等多方面的专家共同协作才能取得满意的效果。还有手术方式治疗的方法，选用既可有效恢复腭裂患者语音，又对上颌骨生长影响作用轻的手术方法。
唇腭裂大多数需要通过手术的方式修复，要配合经验比较丰富的医生。唇腭裂大多数需要配合医生通过蛋白线的方式对局部缝合，从而可以使嘴唇部位恢复到正常的状态时，美观程度提升。在手术前需要完善血常规和尿常规检查，以及肝肾功能检查，要明确自身的体质，是否可以手术以及手术的具体方案。恢复的过程中需要做好个人的护理工作，如果出现了感染性炎症，要及时的采取抗感染治疗，对局部的恢复能够起到促进的作用。
遗传因素，唇腭裂的患者往往在其直系或旁系亲属中也可发现类似的畸形。营养因素，各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生。感染损伤，内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形。孕妇频繁接触x线或微波等，都有可能引起胎儿发育异常而导致唇腭裂的发生。有研究表明，吸烟饮酒也会造成胎儿唇腭裂的发生。
发育畸形做了引产，现再次怀孕，患者因有胎儿畸形发育史，本该要做常规的孕前检查，查找引起胎儿先天发育不良原因，但患者还没来得及做。不能确定是否再次发育畸形可能。引产后两个月又检查出怀孕，子宫内膜还未修复好，土地太贫瘠，有可能导致胎儿发育不良，流产可能。患者引产后未积极避孕，产后没多久就怀孕。
