引起母乳生理性腹泻的原因有：
1.母乳中含有大量的前列腺素，这种激素可以促进儿童小肠平滑肌的运动，增加水分和电解质，造成大便稀；一日两次
2.由于小儿乳糖不耐症，小儿由于乳糖酶不足，对乳糖的耐受性较差，容易造成腹泻。
另外，还会出现由母乳导致的生理性腹泻，多数儿童的外表看起来比较胖，可能会出现轻微的湿疹，宝宝的大便次数会增加，但是不会影响到宝。
生理性腹泻的原因是由于母乳内所含的某种营养成分，如蛋白质或脂肪，超过婴儿的需要，超过婴儿的消化吸收功能，而婴儿的消化能力发育健全，所引起的腹泻。此阶段的孩子常常会出现大便次数偏多，质地也比较偏稀，但是孩子的精神状态比较好，吃东西也正常且玩耍照旧。
小儿生理性腹泻时间为6个月以内。
生理性腹泻主要发生在六个月以内的婴幼儿身上，外观虚胖，长有湿疹，出生后不久就会拉肚子，一天大便数多到十来次，而且一次的便量并不是特别的多，而且没有特别的腥味，除了有一些湿气之外，并没有其他的表现。通常胃口好，没有呕吐，也没有任何的不良反应，在加入了一些辅助食品后，粪便和浊卷可以恢复正常。
生理性腹泻的主要症状是大便次数改变，一般不会出现营养不良、恶心、呕吐等症状，一般不会对身体的生长发育造成影响。
生理性腹泻可以在补充食物的情况下慢慢改善。生理性痢疾容易发展为感染性痢疾，一般表现为大便次数变化，应与感染性腹泻进行鉴别和诊断。生理性腹泻是婴幼儿常见的疾病，可以通过大便常规、血常规等检查来确诊。
新生儿生理性腹泻主要见于6个月以下的孩子，此阶段的孩子常常会出现大便次数偏多，质地也比较偏稀，但是孩子的精神状态比较好。大多是母乳喂养的孩子，主要由于孩子对妈妈母乳中的乳糖不耐受所致。
婴儿生理性腹泻，多见于六个月以下的宝宝，出生后不久就开始腹泻，除了大便次数多以外，无其他症状，宝宝食欲良好，发育正常，外观虚胖，待孩子添加辅食后，大便渐渐转为正常，生理性腹泻不用药物治疗，注意护理就可以了，宝宝大便次数多，所以要勤换尿不湿，用温水洗臀部，保持臀部和会阴部皮肤干净，预防局部感染的发生。