排卵障碍是由于垂体的问题造成的，中枢神经系统下丘脑、垂体、卵巢轴功能紊乱，可导致排卵出现障碍，影响妊娠。垂体的肿瘤也会引起卵巢功能障碍。过度的压力和焦虑等精神因素会影响下丘脑-垂体-卵巢，抑制排卵造成排卵障碍。
排卵障碍多见于内分泌失调，幼稚卵巢，内分泌疾病，营养不良等，内分泌疾病，常见的有卵巢多囊综合症，高泌乳素血症等，内分泌失调多见于黄体功能不足，雌激素水平低的。一些全身性疾病，如重度营养不良，可影响卵巢功能的调节，而导致排卵障碍。
导致不孕排卵障碍的原因有很多，是卵巢部位发生了病变导致的，如多囊卵巢综合症、功能性卵巢肿瘤或者是卵巢子宫内膜异位囊肿又或者是卵巢功能早衰等，都是会引起不孕排卵障碍的。还有是因为内分泌系统出现了紊乱现象引起的。
排卵障碍多数是由于药物性因素，长期服用避孕药、某些减肥药等药物、精神疾病或过度紧张、严重精神疾患或过度恐惧，进而抑制下丘脑分泌促性腺激素释放激素导致无排卵、月经紊乱及闭经，并可伴有血清升高等引起的。
避免排卵障碍的方法有，注意饮食。咖啡因含量多的饮料，还有烟酒的刺激，都极大的影响着女性的生育能力，控制体重，太胖太瘦，都会使女性的内分泌系统受到影响，合适的体重，可以避免排卵障碍，月经的变化，月经周期不稳定，也会影响排卵。