如果只是在显微镜下发现了阴道念珠菌菌丝，没有任何的不适反应，并不需要进行任何处理。一般情况下，可以通过外用药膏来进行调理，但由于念珠菌性阴道炎的病情不同，治疗方法也不尽相同。如病人为复杂的念珠菌感染，一般需用药物超过2个疗程。妊娠期间有念珠菌感染，可以使用少量的外用药物，这样会更保险一些。
女性复发型的阴道念珠菌感染一般一年发生4次或4次。
中医治病特别注意不同的证候和不同的体质，给予不同的药物。一般讲，生殖器念珠菌病是以阴痒、白带增多为主要特征的一种疾病，故中医又称本病为带下病、阴痒病，临床上常根据白带的量、色、气味及全身状况予以辨证施治，一般分为阴虚内热证、肝胆湿热证和脾虚湿热证三型论治。
预防；讲究卫生，勤换内衣尤其是内裤。换下的衣物一定要煮熟消毒处理，避免公共场所的交叉感染。消除发病诱因，对于男性带菌者也必须进行常规治疗，这是杜绝女性复发的重要措施之一。
去国家正规医院接受治疗，对症下药，穿棉质内裤，并且勤换，清洗外阴的毛巾和盆要单独分开。洗后的内裤要放在太阳下爆晒，不要晾置于卫生间内。穿着衣物须透气，不要连续穿着连裤袜或紧身牛仔裤。
一般治疗：积极治疗可以引起阴道炎的其他疾病，消除易感因素。保持外阴清洁干燥，避免搔抓。治疗期间禁止性生活。不宜食用辛辣刺激性食品。中草药治疗：使用具有清热解毒，杀虫止痒作用的中药煎水，熏洗外阴，既可以减轻症状，又能抑制消灭念珠菌。阴道上药；使用药物上药，对霉菌性阴道炎有很好的疗效。口服用药：由于霉菌感染可以通过性生活在夫妻间相互传染，因此可以通过口服用药对双方进行治疗。
念珠菌性阴道炎是由于引道的自然防御功能受到破坏，病原体侵入而导致的，积极的配合治疗，念珠菌性阴道炎的病患是可以适当的运动的，如瑜伽，保龄等，但是不适宜剧烈的运动，平时多注意个人卫生，保持外阴清洁，饮食清淡，多喝水等，及时进行复查。