尿结石导致的疼痛有绞痛和钝痛，是间歇性的。可以沿同侧输尿管方向，放射至下腹部，会阴部，外生殖器，大腿内侧这些地方疼痛，也有可能放射至腰部。还可能会伴有恶心呕吐，但是吐后疼痛感也不能完全缓解；合并感染的时候，会出现寒战高热的现象，可以查泌尿系平片，有助于明确诊断。
尿结石会出现尿频、尿急及尿滴沥的症状。由于结石突然嵌入尿道内，多骤然发生排尿中断，并有强烈尿意及膀胱里急后重，多发生急性尿潴留。结石常是慢慢的长大，早期可无疼痛症状。继发性结石多系突然嵌入尿道内，常突感尿道疼痛和排尿痛。疼痛可向阴茎头、会阴部或直肠放射。
结石在肾盂肾盏中，这时产生疼痛的部位就是在肾脏中。结石的部位在输尿管中，如果卡压在输尿管的情况下，就会引起腰部中段的疼痛。结石在膀胱内，一般是不会引起疼痛的状况。
3-5天，碎石后还会痛几天与病人的碎石手术方式，和病人的身体综合素质、小石头的多少、小石头排除的速度、是否用药、病人的喝水多少等因素有关。尿道结石体外碎石后如果排石干净应该不会再疼痛。
尿结石很痛可以采取体外冲击波碎石手术进行治疗。如果碎石失败，可以输尿管插管或者输尿管镜碎石清石治疗。手术后输尿管留置支架管一个月。碎石治疗如果失败通常都是结石时间太久了已经形成结石包裹所以只能手术碎石了。