系统的牙周治疗包括基础治疗和手术治疗，基础治疗是先进行龈上洁治，恢复1周以后可以进行龈下刮治，祛除引起牙槽骨吸收的牙结石和一些肉芽组织，治疗完成以后1个月以后复诊，复诊时如果牙周袋的探针深度大于5mm，牙周有探针出血，就会考虑做翻瓣术或者牙龈成形术。
牙周病治疗方法有以下两种，手术治疗，基础修复治疗，基础治疗从消除病因和减轻症状两方面入手。修复治疗是在牙周基础治疗的基础上，手术治疗需要进行牙周手术治疗并配合药物治疗。
牙周病需要进行机械的方法去除牙结石、菌斑，恢复牙齿跟牙周组织正常的生理外形和功能。深部洗牙之后龈下刮治和根面平整、翻瓣术、隧道成形术等手术方式。手术之后要注意保持牙齿的清洁。
治疗的方法有药物治疗，牙周袋及根面药物处理，刮除龈下牙石后，对内壁的病理性肉芽用探针蘸腐蚀性药物进入牙周袋达到治疗效果。还有因为牙槽骨炎性吸收破坏，牙齿支持能力下降而无法承担正常的咀嚼压力，出现牙合创伤后可以进行修复治疗的方法。
牙周病的治疗方法有以下两种，手术治疗，基础修复治疗，基础治疗从消除病因和减轻症状两方面入手。对牙周炎的治疗要从消除病因和减轻症状两方面入手，经过上述治疗后，大多数患者的牙周炎症可得到消除。