手术是治疗卵巢囊肿的比较好的方法，用药物治疗只是控制。绝大多数人一般都不会复发，当然也有少部分人会复发，手术以后要定期检查，一定要好好的调养好身体，注意休息保持良好的情绪。
卵巢囊肿有两种类型，一种是生理性的，一种是病理性的。需分情况讨论：
1.生理性：生理性的卵巢囊肿，通常不需要特殊治疗，一般来过月经之后，囊肿会自动消失。这种囊肿是因为受到激素水平波动的影响而暂时性发生，来过月经之后，自己会消失。
2.病理性：病理性的卵巢囊肿，如果没有明显的症状，直径小于五公分，可以先定期观察，暂不手术治疗。若囊肿直径超过五公分，伴有明显的症状，例如有腹痛、不规则的阴道流血、不孕的症状，患者一般需要接受手术治疗，通常预后良好。
卵巢囊肿出现以下情况时是肯定不能怀孕的，卵巢肿瘤生长过快过大时，导致到影响卵巢的血运和排卵，某些卵巢肿瘤出现急慢性扭转、破裂时，影响卵巢血运和引起坏死，继而出现卵巢功能障碍和不排卵，可因其所含肿瘤组织成分不同而产生某些相应激素，从而干扰了卵巢激素的正常分泌和排卵，出现闭经，子宫出血，多毛和不孕等症状。
卵巢囊肿是一种女性生殖器官的恶性肿瘤，其初期无任何征兆，大部分可在身体检查时被诊断出来。
如果是大的卵巢囊肿，会有下腹部一侧隐痛、下腹部坠胀等情况。当卵巢囊肿变大时，会对女性的排卵造成一定的干扰，从而引起月经不调、肥胖、多毛、月经量少等。如果出现了卵巢囊肿，要及时到正规的医疗机构进行手术，比如单孔腹腔镜下卵巢囊肿剥除术。
卵巢囊肿出现扭转需要及时进行外科治疗。
在手术前，不管病人的年纪，都要用肌肉注射止痛药。此外，如果出现了卵巢囊肿，应立即去医院做检查，以免内容物进入腹腔后出现的创面仍然存在，从而导致感染，因此要进行检查和处理，以免损伤到胎儿。卵巢囊肿一般要在怀孕12个星期左右进行检查，如果是生理上的卵巢囊肿，会在怀孕12个星期内逐渐变小。在妊娠期间，怀孕妇女体内的雌性荷尔蒙很可能会不平衡，以致无法保持胎儿的生长。建议口服促进孕酮合成的药物，具体情况取决于囊肿的具体情况。
